В силу того, что широкораспро­страненные определения информационной системы формулируются излишне общо или недостаточно полно, к категории информацион­ных систем часто относят многие системы обработки данных, кото­рые не только поддерживают информационную модель предметной области, но и позволяют решать на ее основе некоторые классы за­дач управленческого, исследовательского, конструкторского или иного характера. По сути дела, такая система представляет собой уже не инфор­мационную систему, а информационную систему вместе с приложением. В эту категорию попадают, например, так называемые корпоративные информационные системы, которые более естественно было бы назы­вать системами управления корпорациями, или системы планирования ресурсов предприятия ERP (Enterprise Resources Planning Systems). Четкую границу между такими системами и информационной системой в определенном здесь смысле провести практически невозможно.

Ситуация усугубляется еще и тем, что специалисты в разных облас­тях, не являясь профессионалами в области информационных систем, часто полагаются на кажущийся интуитивно ясным смысл понятия «информационная система» и в результате весьма вольно с ним обращают­ся, как и с другими «заезженными» терминами. Так обстоит дело, на­пример, с термином база данных. Часто базой данных называют любую совокупность данных, независимо от того, идет ли разговор в контексте технологий баз данных.