История музея КрасГАУ началась в 2000 году, когда ректор КрасГАУ Н.В. Цугленок предложил создать в корпусе агрономического факультета музейную экспозицию «История земледелия и крестьянского быта Приенисейского края с начала XVII до начала XX века». Большую работу по претворению его замыслов осуществили творческий коллектив преподавателей, аспирантов, студентов КрасГАУ и руководитель музея Г.Н. Антоник. По её авторским эскизам и концепции была создана эта часть музея.

Значительную помощь при создании музея оказали проректоры В.А. Иванова, В.Я. Майер и А.Д. Цибульский, В.А. Дель, сотрудники ОКСа В.И. Мельников, Э.В. Перминов, А.А. Абрамчик, Е.И. Сысенко, В.И. Москаленко, начальник столярного цеха В.Ф. Кокорин.

В сентябре 2003 года в аудитории 3–15 главного корпуса открылась еще одна часть музея, посвященная истории КрасГАУ. Там собрано много предметов, связанных с Великой Отечественной войной, - единственная в нашем городе радиотарелка военных лет, которая вещала о событиях с фронта голосом Левитана, студенты отыскали и подарили фотоаппарат-лейку, которым делались снимки на фронте. Есть в музее фронтовая полевая сумка, остатки ржавой гранаты и много других реликвий, документов, связанных с историей КСХИ - КрасГАУ, памятных подарков от друзей и партнеров университета.

Сотрудники кафедры эпизоотологии факультета ветеринарной медицины под руководством профессора Л.И. Тарариной передали музею приборы и фотографии середины прошлого века, которые представлены целой витриной.

Библиотека подарила музею книги, по которым учились первые студенты нашего вуза.

С.Н. Орловский подарил много предметов и книг из библиотеки своего отца - профессора Н.В. Орловского, работавшего в нашем ВУЗе с 1953 по 1963 г.г.

Профессор А.Е Бережной презентовал музею счеты с косточками, на которых сам когда-то работал, А.А. Шпедт - один из первых калькуляторов «Электроника» 1972 года выпуска и другие предметы агронома, студенты факультета механизации сельского хозяйства - арифмометр «Феликс» в футляре, и многие, многие другие сотрудники, студенты, выпускники, не равнодушные к истории родного вуза, приносят в дар музею памятные и ценные для истории КрасГАУ предметы, фотографии, документальные материалы.

Студенты и аспиранты под руководством С.Т. Гайдина собрали трехтомник по теме «История Красноярского края в фотографиях из семейного альбома», который насчитывает три папки по 100 файлов удивительных старинных фотографий с подробным описанием.