Шушенское представительство КрасГАУ организовано по ходатайству администрации и управления образования района в июне 2000 года для проведения консультаций и промежуточных аттестаций для студентов заочной формы обучения, проживающих на юге края. Директором представительства был назначен В.В. Рогило. В 2002 году его сменил А.А. Каминский, а в 2003 году директором назначена Н.З. Майорова. С августа 2004 года директором работает В.В. Дельва.

За время работы представительства налажены связи с администрациями Шушенского и Ермаковского районов, с населением, которые по достоинству оценили экономическую выгоду и доступность в получении высшего профессионального образования. За шесть лет работы выпущено более 200 специалистов, из них пятеро получили дипломы с отличием. В настоящее время услугами представительства пользуются 360 человек четырех факультетов по шести специальностям: «Бухгалтерский учет, анализ и аудит», «Финансы и кредит», «Экономика и управление на предприятии АПК», «Юриспруденция», «Менеджмент организации», «Механизация сельского хозяйства».

География проживания студентов идет от Таймыра до Тувы, которым по различным обстоятельствам выгодно пользоваться услугами Шушенского представительства, но основной состав студентов проживает в Шушенском, Ермаковском районах и Республике Хакасия.